浙江
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1. qPCR
前提：你已经提前锁定目标基因（有明确候选）
作用：精准验证少数基因的表达变化，通量极低
适用场景：已知通路 / 已知靶点，只需要确认几个基因是否改变。
2. RNA-seq
前提：没有候选基因，完全不知道哪些基因会变化
作用：无偏向全基因组扫描，一次性测出全部转录本，挖掘未知新基因、新通路
适用场景：机制初探、造模 / 给药后全局转录变化筛查
3. 正确流程： RNA-seq 全局筛选 → qPCR 挑选关键基因验证 绝大多数情况测序后都要挑基因做 qPCR 核验，让结果更可靠。 反向先 qPCR 再 RNA-seq 仅适合补充深挖，不属于标准实验设计，会浪费测序成本。
编辑：冷漠小 z
内容来源：丁香大师姐（小红书）
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